Die Indikationen für das Autogene Training sind sehr vielfältig, da die Methode jedem Menschen, auch dem gesunden, in vielen Situationen (z.B. Prüfungssituationen, Stresssituationen) von grossem Nutzen sein kann. Deshalb sind im folgenden exemplarisch lediglich einige Indikationen aufgeführt :

Allgemeine Indikationen:

• Behandlung von Ängsten 
• Schmerzbehandlung 
• Kopfschmerzen
• Stressbewältigung 
• Konzentrationssteigerung
• Steigerung körperlicher Leistung (z.B. im Leistungssport) 
• Behandlung von Sucht 
• Behandlung von Schlafstörungen 

Spezielle Indikationen:

• Psychische Krankheitsbilder
• Magen-/Darmerkrankungen 
• Herz-/Kreislauferkrankungen 
• Erkrankungen der Atemwege 
• Störungen der Sexualität 
• Geburtsvorbereitung (Schmerz- und Angstminderung)
• Störungen der Harnblase 
• Hauterkrankungen bes. bei Erkrankungen mit Juckreiz
• Erkrankungen des Bewegungsapparates
• Hormonelle Störungen

Nebenwirkungen:

Nach dem Erlernen bei einer entsprechend fachlich qualifizierten Lehrperson und sachgemässer Anwendung sind unerwünschte Nebenwirkungen auszuschliessen.